今天给大家分享的就是一篇使用oxBS-seq技术对复杂疾病预后相关的潜在表观遗传标志物研究,该研究成果刚刚发表在Clinical & Translational Medicine期刊上。首先,先了解下oxBS-seq的技术原理和优势。
oxBS-Seq技术原理
传统的重亚硫酸盐测序并不能区分DNA甲基化(5mC)和DNA羟甲基化(5hmC),而oxBS-Seq将5hmC氧化5fC,后者可以被Bisulfite转为U,从而实现5mC的精准检测;同时,经过与常规Bisulfite结果比较可以实现对5hmC的准确检测。该技术不仅可以精确检测DNA甲基化,排除DNA羟甲基化的影响,还可以双文库结合同时单碱基分辨率精确检测DNA羟甲基化。该方法非常适合用于需要对DNA甲基化和羟甲基化进行区分的研究测序分析。
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标题:An epigenomic landscape of cervical intraepithelial neoplasia and cervical cancer using single-base resolution methylome and hydroxymethylome(使用oxBS-seq方法对宫颈上皮内瘤变和宫颈癌的表观遗传学研究)
主要结论:系统的描绘了从宫颈上皮内瘤变(CIN)进展为宫颈癌(CC)的甲基化和羟甲基化图谱,揭示了8个与CC预后相关的DNA甲基化/羟甲基化差异化基因,可以作为CC预后的表观遗传标志物。
发表时间:2021年7月19日
期刊:Clinical & Translational Medicine
影响因子:11.492
技术方法:WGBS-seq、oxWGBS-seq、RNA-seq
易基因承担了本研究测序与分析工作