近年来，m6A RNA甲基化作为国家自然科学基金表观遗传学研究的热门领域，相关研究成果层出不穷，高分文章不断。研究方向包括疾病发生发展、发育和分化、环境暴露与响应等。

研究人员为m6A甲基化课题申请作准备以及为降低m6A甲基化实验风险，通常会进行m6A甲基化研究的前期探索性实验，主要包括：

l   检测m6A writers、readers、erasers的表达

l   检测整体m6A甲基化水平变化

l   m6A writers、readers、erasers基因干扰/敲除/过表达

l   其他前期实验

 

一、检测m6A writers、readers、erasers的表达

方法包括：

²  RT-qPCR检测其mRNA表达

²  Western blot检测蛋白质翻译

e.g. 小鼠脑损伤前后观察到METTL14和FTO的RNA表达显著变化

 

二、检测整体m6A甲基化水平变化

方法包括：

²  m6A甲基化免疫荧光染色（定性）

²  m6A斑点杂交（定性）

²  质谱法（定量）

²  比色法（定量）

三、m6A writers、readers、erasers基因干扰/敲除/过表达

方法包括：

²  检测处理后潜在m6A修饰基因的蛋白表达

²  检测处理后所研究的表型和功能变化

白质翻译水平下调，METTL3/14过表达又造成相关基因蛋白质水平上调。

 

四、其他前期实验

在没有条件开展甲基化相关前期实验的情况下，也可以开展其他预实验。如：

²  关键表型指标测定

²  转录组（成本低廉）—— 基于m6A可调节转录本的成熟、降解、稳定性

 

在进行前期探索性预实验后，m6A RNA甲基化的研究思路与项目设计还包括：技术选择、数据挖掘、下游验证。