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近年来,m6A RNA甲基化作为国家自然科学基金表观遗传学研究的热门领域,相关研究成果层出不穷,高分文章不断。研究方向包括疾病发生发展、发育和分化、环境暴露与响应等。
研究人员为m6A甲基化课题申请作准备以及为降低m6A甲基化实验风险,通常会进行m6A甲基化研究的前期探索性实验,主要包括:
l 检测m6A writers、readers、erasers的表达
l 检测整体m6A甲基化水平变化
l m6A writers、readers、erasers基因干扰/敲除/过表达
l 其他前期实验
一、检测m6A writers、readers、erasers的表达
方法包括:
e.g. 小鼠脑损伤前后观察到METTL14和FTO的RNA表达显著变化
二、检测整体m6A甲基化水平变化
方法包括:
三、m6A writers、readers、erasers基因干扰/敲除/过表达
方法包括:
² 检测处理后潜在m6A修饰基因的蛋白表达
² 检测处理后所研究的表型和功能变化
三、m6A writers、readers、erasers基因干扰/敲除/过表达
方法包括:
白质翻译水平下调,METTL3/14过表达又造成相关基因蛋白质水平上调。
四、其他前期实验
在没有条件开展甲基化相关前期实验的情况下,也可以开展其他预实验。如:
在进行前期探索性预实验后,m6A RNA甲基化的研究思路与项目设计还包括:技术选择、数据挖掘、下游验证。
l 技术选择:
² 理解每一步数据分析的目的和依据
² 如何筛选m6A调控的目标基因
l 下游验证:
以上就是关于m6A RNA甲基化研究的前期探索性实验及研究思路分享,易基因科技提供全面的RNA甲基化研究整体解决方案,技术详情请致电易基因0755-28317900。
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