羟甲基化-靶基因甲基化/羟甲基化测序(Target-oxBS+Target-BS)
靶基因亚硫酸盐高通量测序(Target Bisulfite sequencing,Target(- ox)BS)是针对已有目标基因panel组合,运
用易基因自主研发的甲基化特异性多重PCR引物设计软件,对亚硫酸盐转化或氧化亚硫酸盐转化后的目标基因多重
扩增,建库后进行超高深度(1000X以上)甲基化精准检测。
技术优势
1. 超高深度亚硫酸盐甲基化测序,检测准确性极高,完胜传统BSP测序
2. 检测灵敏度高,可准确检测到样本中低于1%的甲基化水平
3. 样本需求量低,20ng基因组DNA可实现多基因扩增
4. 检测费用显著低于现有技术、快周期、超高性价比
5. 平行化学氧化后亚硫酸盐测序,甲基化和羟甲基化精准检测
6. 适用范围广,对基因组DNA、FFPE样本、游离cfDNA等样本均适用
7. 实现近百个基因的多重扩增,检测通量高,优于焦磷酸甲基化测序
实验策略
信息分析
技术参数
研究案例
靶基因DNA甲基化测序验证补充维C可减少后代因母亲妊娠期吸烟而发生的DNA甲基化变化
Vitamin C Prevents Offspring DNA Methylation Changes Associated with Maternal Smoking in Pregnancy
1、背景:
妊娠期吸烟可能导致婴儿出生后终生肺功能下降。此前已有不少研究描述了孕妇吸烟相关的的DNA甲基化变化,如在分娩时的胎盘和脐血、
胎儿肺以及儿童时期的口腔上皮和血液中。本研究为确定补充维生素 C 是否会减少后代因母亲因妊娠期吸烟而发生的甲基化变化。
2、方法:
对胎盘、脐带血样本和口腔样本进行靶向重亚硫酸盐测序,然后使用靶基因DNA甲基化测序对选定的脐带血差异甲基化区域进行独立验证。
3、结论:
安慰剂组和非吸烟者组之间甲基化差异≥10%的大多数CpG(69.03%)在补充维生素C后,至少50%可恢复到非吸烟者水平。恢复的CpG中
有相当一部分与低甲基化CpG富集程度较高的表型结果相关。
Target(- ox)BS用于甲基化多位点甲状腺结节诊断
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表观技术 | 靶基因DNA甲基化和羟甲基化测序 定制精准检测